MARCADORES GENÉTICOS MOLECULARES (FIT-616)

DR. MANUEL HUMBERTO REYES VALDÉS


RESUMEN

Este curso inicia con una introducción a la genética molecular para el entendimiento de las bases de los marcadores de DNA. Posteriormente se describen las técnicas básicas de transferencia, hibridación, restricción, electroforesis y reacción en cadena de la DNA polimerasa. Se describen los principios y técnicas básicas de los marcadores de DNA basados en geles y microarreglos así como sus aplicaciones al mejoramiento de plantas. Posteriormente, se describen los principios y procedimientos del mapeo genético y la selección asistida por marcadores. Se da una introducción a la bioinformática y una descripción de las herramientas básicas como uso de la base de datos del NCBI y los procedimientos BLAST y FASTA.

Durante el curso los estudiantes practican con análisis e interpretación de datos genómicos, a través de diferentes programas computacionales. Un servidor web y ftp (INDIO) está a disposición de los estudiantes en el Laboratorio de Análisis de Genomas, para el acceso a herramientas bioinformáticas y el intercambio de archivosa través de la red. Las prácticas demostrativas de laboratorio se dan con base en los proyectos de investigación que se tienen en marcha.

CONTENIDO

  1. Estructura del material genético
    1. Células y virus
    2. Estructura del DNA
    3. Estructura del RNA
    4. Estructura de la cromatina
    5. El código genético
    6. Genes
    7. Secuencias repetitivas

    Lecturas complementarias
    Molecular Biology Web Book, Capítulo 1A, 3A-3G

  2. Herramientas básicas en la tecnología de DNA
    1. Endonucleasas de restricción
    2. Vectores de clonación
    3. Bibliotecas genómicas
    4. Electroforesis
    5. Transferencias
    6. Reacción en cadena de la DNA polimerasa
    7. Secuenciación de DNA
    8. Microarreglos
    9. Etiquetas des secuencias expresadas (EST)

    Lecturas complementarias
    Molecular Biology Web Book, Capítulo 9A-9F

  3. Sistemas de detección de polimorfismo
    1. Polimorfismo en longitud de fragmentos de restricción (RFLP)
    2. DNA polimórfico amplificado aleatoriamente (RAPD)
    3. Polimorfismo en longitud de repeticiones de secuencia simple (SSR)
    4. Polimorfismo en longitud de fragmentos amplificados (AFLP)
    5. Polimorfismo en nucleótidos simples (SNP)

    Lecturas complementarias

  4. Aplicaciones de los marcadores moleculares
    1. Análisis de diversidad genética
    2. Análisis de ligamiento
    3. Construcción de mapas genéticos
    4. Desarrollo de poblaciones de mapeo en plantas
    5. Análisis de loci que afectan caracteres cuantitativos (QTLs)
    6. Selección asistida por marcadores (MAS)

    Lecturas complementarias

  5. Herramientas bioinformáticas
    1. Base de datos NCBI
    2. BLAST
    3. FASTA
    4. R
    Lecturas

TEXTOS DE APOYO